韩国签证材料会退还吗？
据我所知，目前大多数使馆都不会退签材料的（北京、上海、广州等） 只有少数的领事馆会如你所说的将护照及所有资料退回给你，但只是原封不动地退回而已。
我曾在韩国驻上海总领事馆工作过3年半的时间，期间遇到过一个申请人来领取自己被拒签的材料，当时我就很奇怪因为按照我们的规定是要先通知申请人在指定日期来领取自己的资料的，如果拒签的话也是直接退回给使领馆而不是给到申请人手上啊！后来我才知道是因为该申请者从日本过来韩国旅游再转机去上海的机票是往返套票所以该申请者就认为自己是韩国人，而韩国领事馆的工作人员也没有发现其护照上的入境章并非韩国边防所盖的章而是中国海关所盖的章所以才误给了申请人的。
至于楼主担心的会不会被篡改的问题我认为是不会出现的，因为在递签时所有的申请资料都是要装入大使馆提供的档案袋里的在递交的时候工作人员都会仔细检查并签字画押的而且所有申请人的档案袋上都会贴有相应的条形码以便于日后查询的；除非该领馆工作人员和你很熟不然他们也不敢随意更改的。